Жінки після лікування методом ЕКЗ мають вищий ризик розвитку ускладнень вагітності: токсикозів, мимовільних абортів, передчасних пологів та інших ускладнень під час пологів. Ці ускладнення частіше виникають за багатоплідних вагітностей, ніж за вагітності одним плодом.
На місці пункції після введення препаратів може виникнути подразнення, набряклість м’яких тканин, невеликі крововиливи, а також інфікування. До побічних ефектів введення гормональних препаратів можна віднести: алергічну реакцію, головний біль, висипання, депресію, високу стомлюваність, дратівливість.
Згідно з отриманими даними стало відомо, що ЕКЗ не має негативного впливу на здоров’я дитини. Тобто всі ті страхи, про які багато хто переймався – підвищений ризик онкології, глухоти та інших вад розвитку, не мають під собою реального підґрунтя.
Метод ЕКЗ передбачає потужну гормонотерапію з метою появи якомога більшої кількості яйцеклітин. Це загрожує гіперстимуляцією яєчників.